丙酮酸脱氢酶激酶(PDHK)是一种存在于线粒体内的激酶,能够磷酸化并抑制丙酮酸脱氢酶复合物(PDC)产生,是葡萄糖代谢从线粒体氧化向氧糖酵解转化的关键调控酶。PDHK有四个亚型,分别为PDHK1-4,其中PDHK1与癌症的恶性程度紧密相关。迄今,主要有种不同抑制机制的PDHK抑制剂报道,包括硫辛酸口袋结合的抑制剂(AZD7545和Nov3r)、N末端的螺旋束结合的变构抑制剂(DCA)、ATP竞争型抑制剂(Radicicol)。尽管道报道的PDHK抑制剂数量逐年上升,但抑制的作用机制依然没有突破上述种类型,且针对这一靶点还没有相关的上市药物。因此,开发全新作用机制的PDHK抑制剂具有重要的创新性和应用价值。从这之后,越来越多人发现色谱试剂的价值所在,从而影响很多人的选择。亚索试剂作为一家提供高端研发用试剂的厂家,常备库存万瓶,涵盖通用试剂,分析试剂,有机试剂,无机试剂,生物试剂等,作为知名的化学试剂厂家,欢迎广大客户洽谈选购。https://www.yasuoshiji.com
华东理工大学的李剑教授团队与中科院上海药物研究所的敏、耿美玉、罗成研究员合作,针对李剑自建的老药库(约1400种上市药物),采用基于分子靶标PDHK抑制活性的高通量筛选验,成功发现了一个保护性杀菌剂老药福美双,具有强效的PDHK1抑制活性(IC50=0113±0060μM)。他们以福美双类似物JX06(IC50=0059±0013μM)为靶向化学探针,开展了详细的抑制作用机制研究,首次发现探针分子JX06是一类全新作用机制的PDHK共价抑制剂,通过二硫键共价结合到PDHK1的一个保守的半胱氨酸残基(Cys240),导致识别并结合到PDHK1的ATP结合域(催化域)附近的一个疏水性区域(口袋)。JX06与Cys240共价结合后通过范德华力诱导Arg286构象发生变化,阻碍ATP进入到PDHK1的催化口袋,从而影响PDHK1的酶催化活性,发挥酶抑制作用。尽管道探针分子JX06通过形成二硫键发挥激酶抑制作用,但它对其余323种常见激酶的选择性非常好,而且表现出中等的体内抗肿瘤药效,作为首代PDHK1共价抑制剂表现出良好的成药潜力。该研究的重要应用价值还在于:解释了一个长期模糊不清的靶向肿瘤代谢有效性不佳的问题,即是否存在一个对糖酵解调控更加敏感的肿瘤细胞亚群。研究发现产酸率(ECAR)与耗氧率(OCR)的比值是一个重要的参数,可以作为肿瘤细胞是否对PDHK1抑制剂敏感的判定标准。ECAROCR05的肿瘤细胞对PDHK1抑制剂特异性敏感,导致ROS的增加和明显的细胞凋亡现象。这为基于肿瘤代谢的精准治疗和PDHK1抑制剂的临床发展提供了全新的理论基础(CancerRes,2022,75,4923-4936)。
在推进JX06临床前研究的过程中,作者发现单独应用PDHK1抑制剂仅表现出中等强度的体内抗肿瘤药效,并通过测试共价抑制剂与靶标结合的kinactKi值,证JX06对PDHK亚型的选择性较差,考虑到PDHK1-4具有不同的组织分布和生理功能,非选择性限制了JX06的药物开发。基于此,李剑与敏继续合作,开展了第二代PDHK1共价抑制剂的研究,合成了近100个JX06新结构衍生物(PCTCN2022073384),从中发现了安全性和选择性全面改进的第二代候选化合物3a(JX27),该化合物表现出对PDHK2、3和4分别超出42倍、46倍和~100倍的选择性。罗成等通过分子对接模拟出3a与PDHK1-4的相互作用模式,综合考虑3a与口袋的契合程度以及与共价反应位点处的Cys残基距离,间接证了3a特异性抑制PDHK1的共价机制。
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