1987年,随着X11取得明显成功,MIT希望免除X的管理责任。但是1987年6月与9个厂商举行会晤,这些厂商表示他们相信为了避免 X 由于商业因素而分裂,需要中立方的参与。1988年1月,X协会(X Consortium)做为非营利厂商团体而成立,由Scheifler担任主管,而Keith Packard担任高级开发人员,确保 X 能持续以中立超然的立场提供商业与学术教育所需的开发。1993年,X协会公司(X Consortium, Inc.;非营利性质的公司)做为MIT X协会的接继者而成立
2)开放团体
1997年中,X Consortium将X的管理交给开放团体(The Open Group),而它是1996年由开源软件基金会(Open Software Foundation;OSF)和X/Open合并成立的厂商团体。
最终就像是X11R*许可证争议的回响,XFree86于2004年2月在更加严格许可证下发布了4.4 。许多依赖X的项目认为该许可证无法接受,特别是它和GNU General Public License不兼容。 这引起一场论战,许多人认为到了该对XFree86分叉(fork)的时候了,许多Linux发行版,包括Fedora、Gentoo都纷纷在最新的版本中使用X.Org基金会的发布代替XFree86。
5)X.Org基金会
2004年年初X.Org基金会成立。这意味着 X 在管理上的根本转变。1988年以来 X 的管理者(包括过去的X.Org)都是厂商组织,而基金会由软件开发者领导,采用依靠外部参与的集市模式的社区开发。其成员身份对个人开放,法人成员则成为赞助者。X.Org还开始同freedesktop.org密切合作